ImageJ - Histórico de revisões

Joao.almeida em 17h59min de 4 de janeiro de 2023

2023-01-04T17:59:46Z

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	[[Categoria:Software]]		[[Categoria:Software]]
	[[Categoria:Software Open Source]]		[[Categoria:Software Open-Source]]

Ruibarros: /* Este conteúdo em vídeo */

2017-06-01T21:19:07Z

Este conteúdo em vídeo

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	== Este conteúdo em vídeo ==		== Este conteúdo em vídeo ==

	O vídeo sobre o ImageJ está disponível no [https://uporto.cloud.panopto.eu/Panopto/Pages/Embed.aspx?id=ed8199cc-8795-44d6-b8c2-1bc149364902&v=1 Link Panopto] ou através do youtube.		O vídeo sobre o ''ImageJ'' está disponível no [https://uporto.cloud.panopto.eu/Panopto/Pages/Embed.aspx?id=ed8199cc-8795-44d6-b8c2-1bc149364902&v=1 Link Panopto] ou através do youtube.

	<youtube>https://youtu.be/nkZeMQVT2WY </youtube>		<youtube>https://youtu.be/nkZeMQVT2WY </youtube>

Ruibarros: /* Referências */

2017-06-01T21:01:16Z

Referências

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	~~<p align="justify">~~<references/~~></p~~>		<references/>

	== Links Externos ==		== Links Externos ==

Ruibarros: /* Referências */

2017-06-01T21:00:58Z

Referências

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	<references/>		<p align="justify"><references/></p>


	== Links Externos ==		== Links Externos ==

Ruibarros: /* Variações do ImageJ */

2017-06-01T21:00:29Z

Variações do ImageJ

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	Existem variações baseadas no ''ImageJ'', desenvolvidas por utilizadores de diferentes áreas. Estas variações são exemplos da flexibilidade e expansibilidade.		<p align="justify">Existem variações baseadas no ''ImageJ'', desenvolvidas por utilizadores de diferentes áreas. Estas variações são exemplos da flexibilidade e expansibilidade.</p>
	{\|class="wikitable"		{\|class="wikitable"
	\|+ style="text-align: left;" \|Tabela 1 - Lista de variações do NIH Image e ImageJ <ref name=25anos/>		\|+ style="text-align: left;" \|Tabela 1 - Lista de variações do NIH Image e ImageJ <ref name=25anos/>
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	\|Software de microscopia de código aberto; controla microscópios automatizados; solução de imagem abrangente quando usado com ImageJ; desenvolvido por Arthur Edelstein, Ziah Dean, Henry Pinkard e Nico Stuurman.		\|Software de microscopia de código aberto; controla microscópios automatizados; solução de imagem abrangente quando usado com ImageJ; desenvolvido por Arthur Edelstein, Ziah Dean, Henry Pinkard e Nico Stuurman.
	\|}		\|}


	== Aplicação na área médica==		== Aplicação na área médica==

Ruibarros: /* História */

2017-06-01T21:00:11Z

História

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Linha 46:		Linha 46:


	Em 1987, o programador Wayne Rasband da Research Services Branch (RSB), da NIH, lançou um programa de análise de imagem livre, chamado [https://imagej.nih.gov/nih-image/about.html NIH Image], com o objectivo de permitir aos utilizadores desenvolver novos aplicativos, para as diversas áreas de análise de imagem. Este programa foi desenvolvido para o sistema operativo da Mac. Com o aumento do número de utilizadores houve a necessidade de desenvolver o programa para o sistema operativo da Microsoft, sendo este realizado pela empresa Scion Corporation. No entanto, esta adaptação não foi satisfatória, pois continha muitos “''bugs''” e era paga, não dando a possibilidade da comunidade de utilizadores de a corrigir.		<p align="justify">Em 1987, o programador Wayne Rasband da Research Services Branch (RSB), da NIH, lançou um programa de análise de imagem livre, chamado [https://imagej.nih.gov/nih-image/about.html NIH Image], com o objectivo de permitir aos utilizadores desenvolver novos aplicativos, para as diversas áreas de análise de imagem. Este programa foi desenvolvido para o sistema operativo da Mac. Com o aumento do número de utilizadores houve a necessidade de desenvolver o programa para o sistema operativo da Microsoft, sendo este realizado pela empresa Scion Corporation. No entanto, esta adaptação não foi satisfatória, pois continha muitos “''bugs''” e era paga, não dando a possibilidade da comunidade de utilizadores de a corrigir.</p>

	O aumento de utilizadores da Microsoft na comunidade científica e o aparecimento da linguagem de programação [[Java]], fizeram com que o Wayne Rasband desenvolve-se um programa idêntico ao [[NIH Image]], mas que pudesse ser utilizado nos diferentes sistemas operativos. A este novo programa o autor chamou de ''ImageJ'', para manter a ligação ao [[NIH Image]], com o “J” a indicar o desenvolvimento em [[Java]]. <ref name=25anos> Schneider, C., Rasband, W., Eliceiri, K., [http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n7/full/nmeth.2089.html NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis] Nature Methods, vol. 9 (7), July 2012, pp: 671-675 </ref>
	O primeiro lançamento foi em 23 de setembro de 1997, com a versão 0.50 e, neste momento, está na versão 1.51k, lançado no dia 1 de Março de 2017. <ref>[https://imagej.nih.gov/ij/notes.html Versões do ImageJ]</~~ref~~>

			<p align="justify">O aumento de utilizadores da Microsoft na comunidade científica e o aparecimento da linguagem de programação [[Java]], fizeram com que o Wayne Rasband desenvolve-se um programa idêntico ao [[NIH Image]], mas que pudesse ser utilizado nos diferentes sistemas operativos. A este novo programa o autor chamou de ''ImageJ'', para manter a ligação ao [[NIH Image]], com o “J” a indicar o desenvolvimento em [[Java]]. <ref name=25anos> Schneider, C., Rasband, W., Eliceiri, K., [http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n7/full/nmeth.2089.html NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis] Nature Methods, vol. 9 (7), July 2012, pp: 671-675 </ref>
			O primeiro lançamento foi em 23 de setembro de 1997, com a versão 0.50 e, neste momento, está na versão 1.51k, lançado no dia 1 de Março de 2017. <ref>[https://imagej.nih.gov/ij/notes.html Versões do ImageJ]</ref></p>

	== Variações do '''ImageJ''' ==		== Variações do '''ImageJ''' ==

Ruibarros: /* Funcionalidades */

2017-06-01T20:59:46Z

Funcionalidades

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	<p align="justify">O ''ImageJ'' disponibiliza uma grande variedade de ferramentas de edição, processamento e análise de imagem aplicáveis a imagens de 8-bit, 16-bit e 32-bit. Para além disso,lê e guarda a maioria dos formatos de imagem mais comuns e importantes usados no campo da imagem médica, tais como TIFF, GIF, JPEG, BMP, PNG, ASCII, [[DICOM]] e raw data. Esta lista não acaba por aqui, pois existem plugins desenvolvidos pela comunidade de utilizadores que abrem e guardam outros formatos <ref name=abramoff/>.		<p align="justify">O ''ImageJ'' disponibiliza uma grande variedade de ferramentas de edição, processamento e análise de imagem aplicáveis a imagens de 8-bit, 16-bit e 32-bit. Para além disso,lê e guarda a maioria dos formatos de imagem mais comuns e importantes usados no campo da imagem médica, tais como TIFF, GIF, JPEG, BMP, PNG, ASCII, [[DICOM]] e raw data. Esta lista não acaba por aqui, pois existem plugins desenvolvidos pela comunidade de utilizadores que abrem e guardam outros formatos <ref name=abramoff/>.</p>

	Na edição de imagem, o ''ImageJ'', permite converter imagens de um formato para outro, fazer configurações avançadas de brilho e contraste da imagem, alterar as suas dimensões, inspecionar as suas propriedades, gerir as características específicas de imagens a cores e imagens indexadas, gerir imagens utilizando stacks e hiperstacks, realizar sobre as imagens todo o tipo de transformações geométricas, criar e gerir revestimentos nas imagens, entre outros.		<p align="justify">Na edição de imagem, o ''ImageJ'', permite converter imagens de um formato para outro, fazer configurações avançadas de brilho e contraste da imagem, alterar as suas dimensões, inspecionar as suas propriedades, gerir as características específicas de imagens a cores e imagens indexadas, gerir imagens utilizando stacks e hiperstacks, realizar sobre as imagens todo o tipo de transformações geométricas, criar e gerir revestimentos nas imagens, entre outros.</p>

	Para o processamento de imagem, o ''ImageJ'' fornece diversos filtros, tais como o “passo abaixo”, deteção de bordos, tridimensionais, entre outros. É capaz de fazer convulsões, transformadas de Fourier, operações matemáticas e lógicas. Também disponibiliza soluções para remover ou reduzir vários tipos de ruído.		<p align="justify">Para o processamento de imagem, o ''ImageJ'' fornece diversos filtros, tais como o “passo abaixo”, deteção de bordos, tridimensionais, entre outros. É capaz de fazer convulsões, transformadas de Fourier, operações matemáticas e lógicas. Também disponibiliza soluções para remover ou reduzir vários tipos de ruído. </p>

	Este programa tem um leque variado de ferramentas de análise de imagem, podendo realizar medições em zonas específicas ou na totalidade da imagem. Exemplos destas ferramentas são os: histogramas, as medições de área, dados estatísticos, densidades, etc.		<p align="justify">Este programa tem um leque variado de ferramentas de análise de imagem, podendo realizar medições em zonas específicas ou na totalidade da imagem. Exemplos destas ferramentas são os: histogramas, as medições de área, dados estatísticos, densidades, etc.</p>

	O ''ImageJ'' conta com repositórios oficiais onde são disponibilizadas macros, plugins, scripts e imagens, de diferentes áreas, de forma gratuita. </p>		<p align="justify">O ''ImageJ'' conta com repositórios oficiais onde são disponibilizadas macros, plugins, scripts e imagens, de diferentes áreas, de forma gratuita. </p>


	[[Ficheiro:Imagej interface1.51n.png\|500px\|thumb\|center\|Figura 2: Interface inicial do ''ImageJ'']]		[[Ficheiro:Imagej interface1.51n.png\|500px\|thumb\|center\|Figura 2: Interface inicial do ''ImageJ'']]


	== História ==		== História ==

Ruibarros em 20h58min de 1 de junho de 2017

2017-06-01T20:58:40Z

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	O ''ImageJ'' disponibiliza uma grande variedade de ferramentas de edição, processamento e análise de imagem aplicáveis a imagens de 8-bit, 16-bit e 32-bit. Para além disso,lê e guarda a maioria dos formatos de imagem mais comuns e importantes usados no campo da imagem médica, tais como TIFF, GIF, JPEG, BMP, PNG, ASCII, [[DICOM]] e raw data. Esta lista não acaba por aqui, pois existem plugins desenvolvidos pela comunidade de utilizadores que abrem e guardam outros formatos <ref name=abramoff/>.		<p align="justify">O ''ImageJ'' disponibiliza uma grande variedade de ferramentas de edição, processamento e análise de imagem aplicáveis a imagens de 8-bit, 16-bit e 32-bit. Para além disso,lê e guarda a maioria dos formatos de imagem mais comuns e importantes usados no campo da imagem médica, tais como TIFF, GIF, JPEG, BMP, PNG, ASCII, [[DICOM]] e raw data. Esta lista não acaba por aqui, pois existem plugins desenvolvidos pela comunidade de utilizadores que abrem e guardam outros formatos <ref name=abramoff/>.

	Na edição de imagem, o ''ImageJ'', permite converter imagens de um formato para outro, fazer configurações avançadas de brilho e contraste da imagem, alterar as suas dimensões, inspecionar as suas propriedades, gerir as características específicas de imagens a cores e imagens indexadas, gerir imagens utilizando stacks e hiperstacks, realizar sobre as imagens todo o tipo de transformações geométricas, criar e gerir revestimentos nas imagens, entre outros.		Na edição de imagem, o ''ImageJ'', permite converter imagens de um formato para outro, fazer configurações avançadas de brilho e contraste da imagem, alterar as suas dimensões, inspecionar as suas propriedades, gerir as características específicas de imagens a cores e imagens indexadas, gerir imagens utilizando stacks e hiperstacks, realizar sobre as imagens todo o tipo de transformações geométricas, criar e gerir revestimentos nas imagens, entre outros.
Linha 38:		Linha 38:
	Este programa tem um leque variado de ferramentas de análise de imagem, podendo realizar medições em zonas específicas ou na totalidade da imagem. Exemplos destas ferramentas são os: histogramas, as medições de área, dados estatísticos, densidades, etc.		Este programa tem um leque variado de ferramentas de análise de imagem, podendo realizar medições em zonas específicas ou na totalidade da imagem. Exemplos destas ferramentas são os: histogramas, as medições de área, dados estatísticos, densidades, etc.

	O ''ImageJ'' conta com repositórios oficiais onde são disponibilizadas macros, plugins, scripts e imagens, de diferentes áreas, de forma gratuita.		O ''ImageJ'' conta com repositórios oficiais onde são disponibilizadas macros, plugins, scripts e imagens, de diferentes áreas, de forma gratuita. </p>

Ruibarros: /* Acerca do ImageJ */

2017-06-01T20:58:04Z

Acerca do ImageJ

← Revisão anterior		Revisão das 21h58min de 1 de junho de 2017
Linha 22:		Linha 22:
	<p align="justify">É um programa de edição, processamento e análise de imagem desenvolvido pela National Institutes of Health (NIH) baseado em [[Java]], de download gratuito, do domínio público, de código aberto e não necessita de licença de utilização <ref> [https://www.nih.gov/ National Institutes of Health]</ref>, <ref> [https://imagej.nih.gov/ij/download.html ImageJ download]</ref>. Este programa funciona em diferentes sistemas operativos, como o Windows, MacOs X e Linux.		<p align="justify">É um programa de edição, processamento e análise de imagem desenvolvido pela National Institutes of Health (NIH) baseado em [[Java]], de download gratuito, do domínio público, de código aberto e não necessita de licença de utilização <ref> [https://www.nih.gov/ National Institutes of Health]</ref>, <ref> [https://imagej.nih.gov/ij/download.html ImageJ download]</ref>. Este programa funciona em diferentes sistemas operativos, como o Windows, MacOs X e Linux.
	O ''ImageJ'' é simples de usar, executa um conjunto alargado de manipulações na imagem e pode recorrer a centenas de macros e plugins, desenvolvidos por uma vasta e conhecedora comunidade de utilizadores, desde a nanotecnologia à astronomia, com foco central nas ciências da saúde <ref name=abramoff> Abràmoff, Michael D., Magalhães, Paulo J., Ram, Sunanda J. [https://imagescience.org/meijering/publications/download/bio2004.pdf Image Processing with ImageJ] Biophotonics International, vol. 11, no. 7, July 2004, pp. 36-42</ref>.		O ''ImageJ'' é simples de usar, executa um conjunto alargado de manipulações na imagem e pode recorrer a centenas de macros e plugins, desenvolvidos por uma vasta e conhecedora comunidade de utilizadores, desde a nanotecnologia à astronomia, com foco central nas ciências da saúde <ref name=abramoff> Abràmoff, Michael D., Magalhães, Paulo J., Ram, Sunanda J. [https://imagescience.org/meijering/publications/download/bio2004.pdf Image Processing with ImageJ] Biophotonics International, vol. 11, no. 7, July 2004, pp. 36-42</ref>.
	A capacidade de ser flexível e expansível torna o ''ImageJ'' num programa potente e </p>.		A capacidade de ser flexível e expansível torna o ''ImageJ'' num programa potente e atrativo.</p>

Ruibarros: /* Acerca do ImageJ */

2017-06-01T20:56:50Z

Acerca do ImageJ

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Linha 22:		Linha 22:
	<p align="justify">É um programa de edição, processamento e análise de imagem desenvolvido pela National Institutes of Health (NIH) baseado em [[Java]], de download gratuito, do domínio público, de código aberto e não necessita de licença de utilização <ref> [https://www.nih.gov/ National Institutes of Health]</ref>, <ref> [https://imagej.nih.gov/ij/download.html ImageJ download]</ref>. Este programa funciona em diferentes sistemas operativos, como o Windows, MacOs X e Linux.		<p align="justify">É um programa de edição, processamento e análise de imagem desenvolvido pela National Institutes of Health (NIH) baseado em [[Java]], de download gratuito, do domínio público, de código aberto e não necessita de licença de utilização <ref> [https://www.nih.gov/ National Institutes of Health]</ref>, <ref> [https://imagej.nih.gov/ij/download.html ImageJ download]</ref>. Este programa funciona em diferentes sistemas operativos, como o Windows, MacOs X e Linux.
	O ''ImageJ'' é simples de usar, executa um conjunto alargado de manipulações na imagem e pode recorrer a centenas de macros e plugins, desenvolvidos por uma vasta e conhecedora comunidade de utilizadores, desde a nanotecnologia à astronomia, com foco central nas ciências da saúde <ref name=abramoff> Abràmoff, Michael D., Magalhães, Paulo J., Ram, Sunanda J. [https://imagescience.org/meijering/publications/download/bio2004.pdf Image Processing with ImageJ] Biophotonics International, vol. 11, no. 7, July 2004, pp. 36-42</ref>.		O ''ImageJ'' é simples de usar, executa um conjunto alargado de manipulações na imagem e pode recorrer a centenas de macros e plugins, desenvolvidos por uma vasta e conhecedora comunidade de utilizadores, desde a nanotecnologia à astronomia, com foco central nas ciências da saúde <ref name=abramoff> Abràmoff, Michael D., Magalhães, Paulo J., Ram, Sunanda J. [https://imagescience.org/meijering/publications/download/bio2004.pdf Image Processing with ImageJ] Biophotonics International, vol. 11, no. 7, July 2004, pp. 36-42</ref>.
	A capacidade de ser flexível e expansível torna o ''ImageJ'' num programa potente e <\p>.		A capacidade de ser flexível e expansível torna o ''ImageJ'' num programa potente e </p>.