ImageJ: diferenças entre revisões

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|Data de Lançamento=1987
|Data de Lançamento=1987
|Autor=Wayne Rasband (reformado da NIH)
|Autor=Wayne Rasband (reformado da NIH)
|Entidade Criadora= National Institutes of Health ([https://www.nih.gov/ NIH])
|Entidade Criadora =National Institutes of Health
|Requisitos Técnicos= Java versão 6.0
|Entidade Gestora =National Institutes of Health
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|Versão Atual=1.51k - 1 de Março 2017
|Versão Atual=1.51k - 1 de Março 2017
|Tipo de Licenciamento= Gratuito
|Tipo de Licenciamento=Gratuito
|Sistema Operativo=Windows, MacOS X, Linux (desenvolvido em Java)
|Sistema Operativo=Windows, MacOS X, Linux (desenvolvido em Java)
|Utilizadores Principais= Comunidade científica
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|Função=Edição, processamento e análise de Imagem
|Função=Edição, processamento e análise de Imagem
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[[Ficheiro:Imagej.png]]
== Acerca ==




== O que é o '''ImageJ'''==
É um programa de edição, processamento e análise de imagem desenvolvido pela National Institutes of Health (NIH) baseado em Java, de download gratuito,  do domínio público, de código aberto e não necessita de licença de utilização <ref> [https://www.nih.gov/ National Institutes of Health]</ref>, <ref> [https://imagej.nih.gov/ij/download.html ImageJ download]</ref>. Este programa funciona em diferentes sistemas operativos, como o Windows, MacOs X e Linux.
O ''ImageJ'' é simples de usar, executa um conjunto alargado de manipulações na imagem e pode recorrer a centenas de macros e plugins, desenvolvidos por uma vasta e conhecedora comunidade de utilizadores, desde a nanotecnologia à astronomia, com foco central nas ciências da saúde <ref name=abramoff> Abràmoff, Michael D., Magalhães, Paulo J., Ram, Sunanda J. [https://imagescience.org/meijering/publications/download/bio2004.pdf Image Processing with ImageJ] Biophotonics International, vol. 11, no. 7, July 2004, pp. 36-42</ref>.
A capacidade de ser flexível e expansível torna o ''ImageJ'' num programa potente e atrativo.




É um programa de edição, processamento e análise de imagem desenvolvido pela National Institutes of Health (NIH) baseado em Java, de download gratuito,  do domínio público, de código aberto e não necessita de licença de utilização. <ref> [https://www.nih.gov/ National Institutes of Health]</ref> <ref> [https://imagej.nih.gov/ij/download.html ImageJ download]</ref> Este programa funciona em diferentes sistemas operativos, como o Windows, MacOs X e Linux.
== Funcionalidades ==
O ImageJ é simples de usar, executa um conjunto alargado de manipulações na imagem e pode recorrer a centenas de macros e plugins, desenvolvidos por uma vasta e conhecedora comunidade de utilizadores, desde a nanotecnologia à astronomia, “com foco central nas ciências da saúde”. <ref>[https://imagescience.org/meijering/publications/download/bio2004.pdf]
A capacidade de ser flexível e expansível torna o ImageJ num programa potente e atrativo.
 
== Referências ==
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== Funcionalidades ==
[[Ficheiro:Imagej.png|thumb|right|Figura 1: Logotipo do ''ImageJ'']]


O ImageJ disponibiliza uma grande variedade de ferramentas de edição, processamento e análise de imagem aplicáveis a imagens de 8-bit, 16-bit e 32-bit. Para além disso,lê e guarda a maioria dos formatos de imagem mais comuns e importantes usados no campo da imagem médica, tais como TIFF, GIF, JPEG, BMP, PNG, ASCII, DICOM e raw data. Esta lista não acaba por aqui, pois existem plugins desenvolvidos pela comunidade de utilizadores  que abrem e guardam outros formatos 3.
O ''ImageJ'' disponibiliza uma grande variedade de ferramentas de edição, processamento e análise de imagem aplicáveis a imagens de 8-bit, 16-bit e 32-bit. Para além disso,lê e guarda a maioria dos formatos de imagem mais comuns e importantes usados no campo da imagem médica, tais como TIFF, GIF, JPEG, BMP, PNG, ASCII, [[DICOM]] e raw data. Esta lista não acaba por aqui, pois existem plugins desenvolvidos pela comunidade de utilizadores  que abrem e guardam outros formatos <ref name=abramoff/>.


Na edição de imagem, o ImageJ, permite converter imagens de um formato para outro, fazer configurações avançadas de brilho e contraste da imagem, alterar as suas dimensões, inspecionar as suas propriedades, gerir as características específicas de imagens a cores e imagens indexadas, gerir imagens utilizando stacks e hiperstacks, realizar sobre as imagens todo o tipo de transformações geométricas, criar e gerir revestimentos nas imagens, entre outros.
Na edição de imagem, o ''ImageJ'', permite converter imagens de um formato para outro, fazer configurações avançadas de brilho e contraste da imagem, alterar as suas dimensões, inspecionar as suas propriedades, gerir as características específicas de imagens a cores e imagens indexadas, gerir imagens utilizando stacks e hiperstacks, realizar sobre as imagens todo o tipo de transformações geométricas, criar e gerir revestimentos nas imagens, entre outros.


Para o processamento de  imagem, o ImageJ fornece diversos filtros, tais como o “passo abaixo”, deteção de bordos, tridimensionais, entre outros. É capaz de fazer convulsões, transformadas de Fourier, operações matemáticas e lógicas. Também disponibiliza soluções para remover ou reduzir vários tipos de ruído.  
Para o processamento de  imagem, o ''ImageJ'' fornece diversos filtros, tais como o “passo abaixo”, deteção de bordos, tridimensionais, entre outros. É capaz de fazer convulsões, transformadas de Fourier, operações matemáticas e lógicas. Também disponibiliza soluções para remover ou reduzir vários tipos de ruído.  


Este programa tem um leque variado de ferramentas de análise de imagem, podendo realizar medições  em zonas específicas ou na totalidade da imagem. Exemplos destas ferramentas são os: histogramas, as medições de área, dados estatísticos, densidades, etc.
Este programa tem um leque variado de ferramentas de análise de imagem, podendo realizar medições  em zonas específicas ou na totalidade da imagem. Exemplos destas ferramentas são os: histogramas, as medições de área, dados estatísticos, densidades, etc.


Este programa conta com repositórios oficiais onde são disponibilizadas macros, plugins, scripts e imagens, de diferentes áreas, de forma gratuita.
O ''ImageJ'' conta com repositórios oficiais onde são disponibilizadas macros, plugins, scripts e imagens, de diferentes áreas, de forma gratuita.  




== História ==
== História ==


Em 1987, o programador Wayne Rasband da Research Services Branch (RSB), da NIH,
Em 1987, o programador Wayne Rasband da Research Services Branch (RSB), da NIH, lançou um programa de análise de imagem livre, chamado [https://imagej.nih.gov/nih-image/about.html NIH Image], com o objectivo de permitir aos utilizadores desenvolver novos aplicativos, para as diversas áreas de análise de imagem. Este programa foi desenvolvido para o sistema operativo da Mac. Com o aumento do número de utilizadores houve a necessidade de desenvolver o programa para o sistema operativo da Microsoft, sendo este realizado pela empresa Scion Corporation. No entanto, esta adaptação não foi satisfatória, pois continha muitos “''bugs''” e era paga, não dando a possibilidade da comunidade de utilizadores de a corrigir.
lançou um programa de análise de imagem livre, chamado NIH Image, com o objectivo de permitir aos utilizadores desenvolver novos aplicativos, para as diversas áreas de análise de imagem. Este programa foi desenvolvido para o sistema operativo da Mac. Com o aumento do número de utilizadores houve a necessidade de desenvolver o programa para o sistema operativo da Microsoft, sendo este realizado pela empresa Scion Corporation. No entanto, esta adaptação não foi satisfatória, pois continha muitos “bugs” e era paga, não dando a possibilidade da comunidade de utilizadores de a corrigir.
O aumento de utilizadores da Microsoft na comunidade científica e o aparecimento da linguagem de programação Java, fizeram com que o Wayne Rasband desenvolve-se um programa idêntico ao NIH Image, mas que pudesse ser utilizado nos diferentes sistemas operativos. A este novo programa o autor chamou de ImageJ, para manter a ligação ao NIH Image, com o “J” a indicar o desenvolvimento em Java. 4
O primeiro lançamento foi em 23 de setembro de 1997, com a versão 0.50 e, neste momento, está na versão 1.51k, lançado no dia 1 de Março de 2017. 5


O aumento de utilizadores da Microsoft na comunidade científica e o aparecimento da linguagem de programação Java, fizeram com que o Wayne Rasband desenvolve-se um programa idêntico ao NIH Image, mas que pudesse ser utilizado nos diferentes sistemas operativos. A este novo programa o autor chamou de ''ImageJ'', para manter a ligação ao NIH Image, com o “J” a indicar o desenvolvimento em Java. <ref> Schneider, C., Rasband, W., Eliceiri, K., [http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n7/full/nmeth.2089.html NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis] Nature Methods, vol. 9 (7), July 2012, pp: 671-675 </ref>
O primeiro lançamento foi em 23 de setembro de 1997, com a versão 0.50 e, neste momento, está na versão 1.51k, lançado no dia 1 de Março de 2017. <ref>[https://imagej.nih.gov/ij/notes.html Versões do ImageJ]</ref>
== Referências ==
<references/>





Revisão das 10h38min de 7 de abril de 2017

ImageJ
Sigla
Designação ImageJ
Data de Lançamento 1987
Entidade Criadora National Institutes of Health
Entidade Gestora National Institutes of Health
Versão Atual 1.51k - 1 de Março 2017
Requisitos Técnicos
Tipo de Licenciamento
Arquitetura
Sistema Operativo
Especialidade Médica
Utilizadores Principais
Função Edição, processamento e análise de Imagem


Acerca

É um programa de edição, processamento e análise de imagem desenvolvido pela National Institutes of Health (NIH) baseado em Java, de download gratuito, do domínio público, de código aberto e não necessita de licença de utilização [1], [2]. Este programa funciona em diferentes sistemas operativos, como o Windows, MacOs X e Linux. O ImageJ é simples de usar, executa um conjunto alargado de manipulações na imagem e pode recorrer a centenas de macros e plugins, desenvolvidos por uma vasta e conhecedora comunidade de utilizadores, desde a nanotecnologia à astronomia, com foco central nas ciências da saúde [3]. A capacidade de ser flexível e expansível torna o ImageJ num programa potente e atrativo.


Funcionalidades

Figura 1: Logotipo do ImageJ

O ImageJ disponibiliza uma grande variedade de ferramentas de edição, processamento e análise de imagem aplicáveis a imagens de 8-bit, 16-bit e 32-bit. Para além disso,lê e guarda a maioria dos formatos de imagem mais comuns e importantes usados no campo da imagem médica, tais como TIFF, GIF, JPEG, BMP, PNG, ASCII, DICOM e raw data. Esta lista não acaba por aqui, pois existem plugins desenvolvidos pela comunidade de utilizadores que abrem e guardam outros formatos [3].

Na edição de imagem, o ImageJ, permite converter imagens de um formato para outro, fazer configurações avançadas de brilho e contraste da imagem, alterar as suas dimensões, inspecionar as suas propriedades, gerir as características específicas de imagens a cores e imagens indexadas, gerir imagens utilizando stacks e hiperstacks, realizar sobre as imagens todo o tipo de transformações geométricas, criar e gerir revestimentos nas imagens, entre outros.

Para o processamento de imagem, o ImageJ fornece diversos filtros, tais como o “passo abaixo”, deteção de bordos, tridimensionais, entre outros. É capaz de fazer convulsões, transformadas de Fourier, operações matemáticas e lógicas. Também disponibiliza soluções para remover ou reduzir vários tipos de ruído.

Este programa tem um leque variado de ferramentas de análise de imagem, podendo realizar medições em zonas específicas ou na totalidade da imagem. Exemplos destas ferramentas são os: histogramas, as medições de área, dados estatísticos, densidades, etc.

O ImageJ conta com repositórios oficiais onde são disponibilizadas macros, plugins, scripts e imagens, de diferentes áreas, de forma gratuita.


História

Em 1987, o programador Wayne Rasband da Research Services Branch (RSB), da NIH, lançou um programa de análise de imagem livre, chamado NIH Image, com o objectivo de permitir aos utilizadores desenvolver novos aplicativos, para as diversas áreas de análise de imagem. Este programa foi desenvolvido para o sistema operativo da Mac. Com o aumento do número de utilizadores houve a necessidade de desenvolver o programa para o sistema operativo da Microsoft, sendo este realizado pela empresa Scion Corporation. No entanto, esta adaptação não foi satisfatória, pois continha muitos “bugs” e era paga, não dando a possibilidade da comunidade de utilizadores de a corrigir.

O aumento de utilizadores da Microsoft na comunidade científica e o aparecimento da linguagem de programação Java, fizeram com que o Wayne Rasband desenvolve-se um programa idêntico ao NIH Image, mas que pudesse ser utilizado nos diferentes sistemas operativos. A este novo programa o autor chamou de ImageJ, para manter a ligação ao NIH Image, com o “J” a indicar o desenvolvimento em Java. [4] O primeiro lançamento foi em 23 de setembro de 1997, com a versão 0.50 e, neste momento, está na versão 1.51k, lançado no dia 1 de Março de 2017. [5]

Referências

  1. National Institutes of Health
  2. ImageJ download
  3. 3,0 3,1 Abràmoff, Michael D., Magalhães, Paulo J., Ram, Sunanda J. Image Processing with ImageJ Biophotonics International, vol. 11, no. 7, July 2004, pp. 36-42
  4. Schneider, C., Rasband, W., Eliceiri, K., NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis Nature Methods, vol. 9 (7), July 2012, pp: 671-675
  5. Versões do ImageJ